Det går daglig rutefly fra Skandinavia til Praha. Fra Stockholm Arlanda kan du f.eks. reise med SAS eller Czech Airlines. Flybillett hit er heller ikke spesielt dyrt.
Prahas flyplass ligger 17 km utenfor selve bykjernen. Den billigste måten å ta seg inn til sentrum på, er å først ta lokalbuss nr.119 til Dejvicka, og deretter t-bane videre. Man kan også ta minibusser, Cedaz, som det koster ca. 35 kr å reise med. Hvis du foretrekker drosje, så koster reisen mellom flyplassen og sentrum ca. 140 kr.
Fra Oslo flyr man enklest til Prague (PRG). Flyselskaper som har gode tilbud på denne ruten er Ryanair, Norwegian Air Shuttle, Air Baltic, Scandinavian Airlines, Brussels Airlines. Typiske priser starter fra 937 NOK, eller 937 NOK med direktefly. Flyreiser mellom Oslo og Prague tar ca 9h, 0 min, og direktefly fra Oslo og Prague ca. 2h, 0 min. Praha sentrum er 2,3 km. fra Prague. Andre flyplasser i nærheten av Praha er Vodochody Airport (VOD), Prague Main Railway Station (XYG), Pardubice (PED).